Projektowanie leków

Informacje ogólne

Kod przedmiotu:	1100-4PM13
Kod Erasmus / ISCED:	11.954 Kod klasyfikacyjny przedmiotu składa się z trzech do pięciu cyfr, przy czym trzy pierwsze oznaczają klasyfikację dziedziny wg. Listy kodów dziedzin obowiązującej w programie Socrates/Erasmus, czwarta (dotąd na ogół 0) – ewentualne uszczegółowienie informacji o dyscyplinie, piąta – stopień zaawansowania przedmiotu ustalony na podstawie roku studiów, dla którego przedmiot jest przeznaczony. / (0619) Komputeryzacja (inne) Kod ISCED - Międzynarodowa Standardowa Klasyfikacja Kształcenia (International Standard Classification of Education) została opracowana przez UNESCO.
Nazwa przedmiotu:	Projektowanie leków
Jednostka:	Wydział Fizyki
Grupy:	ZFBM, II stopień; Projektowanie molekularne i bioinformatyka
Punkty ECTS i inne:	(brak) Podstawowe informacje o zasadach przyporządkowania punktów ECTS: roczny wymiar godzinowy nakładu pracy studenta konieczny do osiągnięcia zakładanych efektów uczenia się dla danego etapu studiów wynosi 1500-1800 h, co odpowiada 60 ECTS; tygodniowy wymiar godzinowy nakładu pracy studenta wynosi 45 h; 1 punkt ECTS odpowiada 25-30 godzinom pracy studenta potrzebnej do osiągnięcia zakładanych efektów uczenia się; tygodniowy nakład pracy studenta konieczny do osiągnięcia zakładanych efektów uczenia się pozwala uzyskać 1,5 ECTS; nakład pracy potrzebny do zaliczenia przedmiotu, któremu przypisano 3 ECTS, stanowi 10% semestralnego obciążenia studenta. zobacz reguły punktacji
Język prowadzenia:	polski
Rodzaj przedmiotu:	obowiązkowe
Pełny opis:	Metody obrazowania powierzchni receptorów. Najważniejsze typy oddziaływania niekowalencyjnych, na poziomie mikroskopowym i mezoskopowym, Model klucz-zamek vs. dopasowanie ligand-receptor - efekty entropowe. Wpływ rozpuszczalnika, efekt desolwatacji. Zarys rozwoju nowych metodologii, m.in. pełnego wzajemnego dopasowania się receptora i inhibitora. Makromolekuły jako cel działania leku. Sposoby przygotowania receptora pochodzącego z różnych źródeł (Xray, NMR, HomMod). Analiza centrum aktywnego oraz metody przewidywania centrum aktywnego. Przegląd baz małych cząsteczek, metody przeszukiwania baz (2D, 3D, problem konformacyjny). Porównywanie cząsteczek – metody wyliczania podobieństwa, deskryptory molekularne, współczynnik podobieństwa i współczynnik odległości (Tanimoto, etc), budowa farmakoforów. Metody projektowania bibliotek (różnorodność – diversity set), wybór „lekopodobnych cząsteczek” , reguła Lipińskiego, chemia kombinatoryczna. Wykorzystanie baz cząstek chemicznych do dokowania (przegląd algorytmów i oprogramowania) . Projektowanie de-novo, automatyczne metody tworzenia cząsteczek: inside-out i outside-in, definiowanie miejsc lokalizacji grup chemicznych, wady i zalety podejścia. Projektowanie na podstawie znanych związków bądź cech (farmakoforu), projektowanie analogów. Wyliczanie energii wiązania z pól siłowych, metody wyznaczania różnic energii swobodnej, m.in. komputerowej alchemii. Przegląd funkcji oceniających dopasowanie, zalety i wady. Wyliczanie energii desolwatacji. QSAR: zależność aktywności od struktury, metodologia, przegląd równań, walidacja, chiralność i aktywność biologiczna, ADME.
Efekty uczenia się:	- zna typowe problemy projektowania leków (K_W07) - ma podstawową wiedzę dotyczącą uwarunkowań prawnych i etycznych związanych z działalnością naukową i dydaktyczną (K_W11) - zna ogólne zasady tworzenia i rozwoju form indywidualnej przedsiębiorczości, wykorzystującej wiedzę z zakresu bioinformatyki (K_W12) - potrafi analizować strukturę i funkcję układów biomolekularnych związanych z procesami chorobowymi (K_U10) - potrafi wykorzystywać nabytą wiedzę w innych dziedzinach, m.in. w diagnostyce medycznej, projektowaniu leków oraz w zagadnieniach biologii medycznej, genomiki, proteomiki oraz biologii systemów (K_U11) - potrafi dokonać analizy właściwości zarówno małych cząsteczek jak i receptora (K_U12) - potrafi dokonać wyboru metody projektowania leków w zależności od typu problemu i danych jakimi dysponuje (K_U13) - ma świadomość odpowiedzialności za podejmowane inicjatywy badań, eksperymentów lub obserwacji (K_K02) - rozumie i docenia znaczenie uczciwości intelektualnej w działaniach własnych i innych osób; postępuje etycznie (K_K03) - potrafi myśleć i działać w sposób przedsiębiorczy (K_K06)

Przedmiot nie jest oferowany w żadnym z aktualnych cykli dydaktycznych.

Opisy przedmiotów w USOS i USOSweb są chronione prawem autorskim.
Właścicielem praw autorskich jest Uniwersytet Warszawski.