Obliczeniowa medycyna molekularna

Informacje ogólne

Kod przedmiotu:	1000-2M14OMM
Kod Erasmus / ISCED:	11.3 Kod klasyfikacyjny przedmiotu składa się z trzech do pięciu cyfr, przy czym trzy pierwsze oznaczają klasyfikację dziedziny wg. Listy kodów dziedzin obowiązującej w programie Socrates/Erasmus, czwarta (dotąd na ogół 0) – ewentualne uszczegółowienie informacji o dyscyplinie, piąta – stopień zaawansowania przedmiotu ustalony na podstawie roku studiów, dla którego przedmiot jest przeznaczony. / (0612) Database and network design and administration Kod ISCED - Międzynarodowa Standardowa Klasyfikacja Kształcenia (International Standard Classification of Education) została opracowana przez UNESCO.
Nazwa przedmiotu:	Obliczeniowa medycyna molekularna
Jednostka:	Wydział Matematyki, Informatyki i Mechaniki
Grupy:	Przedmioty obieralne dla informatyki Przedmioty obieralne na studiach drugiego stopnia na kierunku bioinformatyka
Punkty ECTS i inne:	(brak) Podstawowe informacje o zasadach przyporządkowania punktów ECTS: roczny wymiar godzinowy nakładu pracy studenta konieczny do osiągnięcia zakładanych efektów uczenia się dla danego etapu studiów wynosi 1500-1800 h, co odpowiada 60 ECTS; tygodniowy wymiar godzinowy nakładu pracy studenta wynosi 45 h; 1 punkt ECTS odpowiada 25-30 godzinom pracy studenta potrzebnej do osiągnięcia zakładanych efektów uczenia się; tygodniowy nakład pracy studenta konieczny do osiągnięcia zakładanych efektów uczenia się pozwala uzyskać 1,5 ECTS; nakład pracy potrzebny do zaliczenia przedmiotu, któremu przypisano 3 ECTS, stanowi 10% semestralnego obciążenia studenta. zobacz reguły punktacji
Język prowadzenia:	angielski
Rodzaj przedmiotu:	monograficzne
Założenia (lista przedmiotów):	Wstęp do biologii obliczeniowej 1000-2N03BO
Skrócony opis:	Najważniejsze modele i metody obliczeniowe używane w analizie molekularnych danych medycznych. Wykształcenie umiejętności posługiwania się podstawowymi algorytmami stosowanymi w diagnostyce medycznej.
Pełny opis:	Program 1.Wstęp do biologii i medycyny molekularnej. 2.Podstawowe biotechnologie: mikromacierze, spektrometria mas, sekwencjonowanie. 3.Mikromacierze hybrydyzacyjne: algorytmy analizy danych. 4.Strukturalne mutacje, a architektura genomu. 5.Choroby mendlowskie. 6.Mikromacierze transkryptomiczne: algorytmy analizy danych. 7.Mikromacierze transkryptomiczne w diagnostyce nowotworów. 8.Spektrometria mas: algorytmy interpretacji widma. 9.Spektrometria mas w diagnostyce medycznej. 10.Modelowanie molekularnych szlaków sygnałowych. 11. Analiza modeli szlaków. 12.Onkogenne szlaki sygnałowe.
Literatura:	Darren Wilkinson, Stochastic Modelling for Systems Biology, Chapman & Hall, 2011. K.A. Do, Z.S. Qin, M. Vanucci, Advances in Statistical Bioinformatics Models and Integrative Inference for High-Throughput Data, Cambridge University Press, 2013.
Efekty uczenia się:	Wiedza: 1. ma pogłębioną wiedzę z działów matematyki niezbędnych do studiowania bioinformatyki (rachunek prawdopodobieństwa, statystyka, równania różniczkowe) (K_W01) Umiejętności 1. posiada pogłębioną umiejętność przygotowania wystąpień ustnych, w języku polskim i języku obcym, w zakresie informatyki lub w obszarze leżącym na pograniczu różnych dyscyplin naukowych (K_U11) 2. potrafi przygotować (także w języku angielskim) opracowanie naukowe z wybranej dziedziny informatyki (K_U13) Kompetencje 1. zna ograniczenia własnej wiedzy i rozumie potrzebę dalszego kształcenia, w tym zdobywania wiedzy poza-dziedzinowej (K_K01) 2. potrafi precyzyjnie formułować pytania, służące pogłębieniu własnego zrozumienia danego tematu (w szczególności w kontaktach z nie-informatykiem) lub odnalezieniu brakujących elementów rozumowania (K_K02)
Metody i kryteria oceniania:	Prezentacja i projekt, które trzeba zaliczyć, żeby przystąpić do egzaminu (egzamin ustny).

Przedmiot nie jest oferowany w żadnym z aktualnych cykli dydaktycznych.

Opisy przedmiotów w USOS i USOSweb są chronione prawem autorskim.
Właścicielem praw autorskich jest Uniwersytet Warszawski.