Serwisy internetowe Uniwersytetu Warszawskiego | USOSownia - uniwersyteckie forum USOSoweNie jesteś zalogowany | zaloguj się
katalog przedmiotów - pomoc

Struktura polimerów i biopolimerów

Informacje ogólne

Kod przedmiotu: 1200-2BLOK7-BIOW5 Kod Erasmus / ISCED: 13.3 / (0531) Chemia
Nazwa przedmiotu: Struktura polimerów i biopolimerów
Jednostka: Wydział Chemii
Grupy: Chemia i biologia strukturalna (S2-CH)
Punkty ECTS i inne: 1.50
zobacz reguły punktacji
Język prowadzenia: polski
Kierunek podstawowy MISMaP:

biologia
biotechnologia
chemia
fizyka
informatyka

Rodzaj przedmiotu:

obowiązkowe

Założenia (opisowo):

Słuchacze powinni posiadać podstawową wiedzę z zakresu biochemii (wiedzieć o istnieniu białek, DNA i RNA) oraz z chemii (o wiązaniu wodorowym, oddziaływaniach hydrofobowych itd.)

Tryb prowadzenia:

w sali

Skrócony opis:

Wykład wprowadza studenta w świat struktur biomolekuł i uczy postrzegać je z wielu punktów widzenia, od ewolucyjnego do fizykochemicznego.

Pełny opis:

Celem wykładu jest uzasadnienie, dlaczego biopolimery naturalne: białka i kwasy nukleinowe mają taką a nie inną strukturę.

1) Statystyczny opis polimerów syntetycznych

Rodzaje polimerów syntetycznych i ich parametry fizykochemiczne: promień żyracji, kłębek losowy, długość Kuhna. Modele teoretyczne.

2) Budowa chemiczna białek i ich struktura drugorzędowa

Białka jako polimery naturalne. Wiązanie peptydowe i jego geometria. Kąty Phi, Psi, omega. Oddziaływania odpowiedzialne za powstawanie struktury drugorzędowej: wiązania wodorowe i wyłączona objętość. Geometryczny opis alfa-helis i beta-kartek. Mapa Ramachandrana

3) Struktura trzeciorzędowa

Oddziaływania stabilizujące strukturę trzeciorzędową białka. Mapa kontaktów. Pojęcie rotameru. Nakładanie struktur białek: parametry crsmd i GDT.

4) Struktura kwasów nukleinowych: DNA i RNA

5) Ewolucyjne spojrzenie na struktury białek i RNA

Rodziny sekwencji i struktur; klasy strukturalne białek

6) Termodynamiczny opis fałdowania się białek

Paradoks Levinthala; hipoteza Anfinsena; bilans entropii i entalpii w trakcie zwijania się białka; Chaperony

7) Projektowanie i inżynieria białek i kwasów nukleinowych

Efekty kształcenia:

Student umie opisać, jak zbudowane są białka i kwasy nukleinowe a także umie uzasadnić, z czego ta struktura wynika. Rozumie, jak proces ewolucji sekwencji powiązany jest ze strukturą białek.

Metody i kryteria oceniania:

Test zaliczeniowy składający się z około 10 pytań zamkniętych i 5 otwartych.

Zajęcia w cyklu "Semestr zimowy 2018/19" (w trakcie)

Okres: 2018-10-01 - 2019-01-25
Wybrany podział planu:


powiększ
zobacz plan zajęć
Typ zajęć: Wykład, 15 godzin więcej informacji
Koordynatorzy: Dominik Gront, Andrzej Koliński
Prowadzący grup: Dominik Gront, Andrzej Koliński
Lista studentów: (nie masz dostępu)
Zaliczenie: Egzamin
Opisy przedmiotów w USOS i USOSweb są chronione prawem autorskim.
Właścicielem praw autorskich jest Uniwersytet Warszawski.