Uniwersytet Warszawski - Centralny System UwierzytelnianiaNie jesteś zalogowany | zaloguj się
katalog przedmiotów - pomoc

Modelowanie molekularne i obliczeniowa biologia strukturalna 2 1000-716MM2
Semestr letni 2020/21
Laboratorium, grupa nr 1

powiększ
plan zajęć przedmiotu
zaznaczono (na zielono) terminy
aktualnie wyświetlanej grupy
To jest strona grupy zajęciowej. Jeśli szukasz opisu przedmiotu, zobacz stronę przedmiotu
Przedmiot Modelowanie molekularne i obliczeniowa biologia strukturalna 2 1000-716MM2
Zajęcia Semestr letni 2020/21 (2020L) (zakończony)
Laboratorium (LAB), grupa nr 1 [pozostałe grupy]
Termin i miejsce:
każdy wtorek, 10:15 - 12:00
sala 4.73/4.74
W.Fizyki budynek A i B CeNT II - Pasteura 5 jaki jest adres?
Terminy najbliższych spotkań: Wszystkie zajęcia tej grupy już się odbyły - pokaż terminy wszystkich spotkań.
Liczba osób w grupie: 2
Limit miejsc: 15
Prowadzący: Bartosz Greń
Zakres tematów:

Algorytmy całkujące równania ruchu: algorytm Eulera, algorytm Verleta, algorytm żabiego skoku. Dynamika molekularna, potencjał Lennarda-Jonesa, termostat, periodyczne warunki brzegowe. Symulacje Monte Carlo. Model Isinga.

Metody i kryteria oceniania:

Ćwiczenia są na zaliczenie (zal). Zaliczenie czterech ćwiczeń:

1) Prosta dynamika molekularna. Ruch ciała w polu innego, nieruchomego ciała (np. ruch Księżyca wokół Ziemi) z porównaniem różnych algorytmów całkujących.

2) Wielociałowa dynamika molekularna. Ruch wielu wzajemnie ze sobą oddziałujących ciał.

3) Dynamika Monte Carlo na przykładzie Modelu Isinga.

4) Prosty model zwijania białka z wykorzystaniem Monte Carlo.

Opisy przedmiotów w USOS i USOSweb są chronione prawem autorskim.
Właścicielem praw autorskich jest Uniwersytet Warszawski.