Biologia mikroorganizmów eukariotycznych 1400-226BME
Ćwiczenia (CW) Semestr zimowy 2018/19

Podstawową literaturę będą stanowiły publikacje naukowe sukcesywnie podawane do wiadomości w trakcie zajęć.

Dodatkowo można skorzystać z podręczników anglojęzycznych:

1.Eukaryotic Microbes (2011) pod redakcją M. Schaechter

2. Parasitology in Focus - H. Mehlhorn

3. Graham L.D., Wilcox, L. 2000. Algae. Prentice-Hall, Inc., NJ.

4. Mueller G.M., Bills G.F., Foster MS. 2004. Biodiversity of Fungi. Inventory and Monitoring Methods. Elsevier Academis Press.

5. Moore D., Robson G.D., Trinci A.P.J. 2011. 21st Century Guidebook to Fungi. Cambridge University Press. Manchester, UK.

WIEDZA

1. (K_W03 Bl2) Zna zróżnicowanie strukturalne, genetyczne, metaboliczne i funkcjonalne mikroorganizmów eukariotycznych.

2. (K_W04 Bl2) Wskazuje związek pomiędzy środowiskiem, a różnorodnością mikroorganizmów; porównuje warunki życia mikroorganizmów ze środowiska wodnego i lądowego.

3. (K_W05 Bl2) Rozumie reguły komórkowe i fizjologiczne rozwoju oraz funkcjonowania mikroorganizmów eukariotycznch

4. (K_W06 Bl2) Zna specjalistyczne pojęcia terminologii związanej z mikroorganizmami eukariotycznymi oraz literaturę kierunkową z tych obszarów

5. (K_W07 Bl2) Zna główne grupy taksonomiczne zaliczane do mikroorganizmów eukariotycznych, ich pochodzenie i wzajemne relacje; wie do jakich grup ekologicznych należą przedstawiciele poznanych grup organizmów.

6. (K_W10 Bl2) Zna różnorodne techniki i narzędzia badawcze, stosowane w badaniach mikroorganizmów eukariotycznych i właściwie planuje ich wykorzystanie do rozwiązywania postawionych zadań

7. (K_W13 Bl2) Zna zasady planowania badań i wykonywania eksperymentów z zastosowaniem specjalistycznych metod stosowanych w badaniach mikroorganizmów eukariotycznych.

UMIEJĘTNOŚCI

1. (K_U01 Bl2) Potrafi pobrać materiał ze środowiska, izolować i prowadzić hodowle laboratoryjne mikroorganizmów eukariotycznych oraz wykonać preparaty.

2. Przygotowuje prezentację ustną problemów związanych z tematyką zajęć z wykorzystaniem tekstów naukowych i popularnonaukowych w języku ojczystym i angielskim. (K_U03 Bl2; K_U09 Bl2; K_U11BI2)

3. (K_U03 Bl2; K_U09 Bl2; K_U010 Bl2) Pisze prace badawcze z zakresu biologii mikroorganizmów eukariotycznych w języku polskim na podstawie własnych badań i literatury źródłowej.

KOMPETENCJE SPOŁECZNE

1. (K_K01 Bl2) Rozumie potrzebę odkrywania nowych gatunków i identyfikacji znanych gatunków mikroorganizmów eukariotycznych i potrafi przekazać tę wiedzę innym.

2. (K_K03 Bl2) Potrafi przekazać społeczeństwu wiedzę o najnowszych osiągnięciach z zakresu biologii mikroorganizmów eukariotycznych i wyjaśnić zasadność prowadzenia podstawowych badań w tym obszarze.

3. (K_K04 Bl2) Potrafi pracować w zespole, realizując własne badania i współorganizując pracę całego zespołu.

4. (K_K08 Bl2) Wykazuje odpowiedzialność za ocenę zagrożeń wynikających z pracy z toksycznymi i chorobotwórczymi mikroorganizmami eukariotycznymi.

5. (K_K10 Bl2) Krytycznie analizuje informacje medialne z zakresu biologii mikroorganizmów eukariotycznych i potrafi wykorzystać je w praktyce.

Wymagana obecność na zajęciach (dopuszczalne dwie nieobecności podczas cyklu zajęć) oraz przygotowanie dwóch krótkich prezentacji ustnych (w sumie 20% oceny końcowej) oraz pisemnego opracowania projektu zrealizowanego w trakcie zajęć (w formie niewielkiej publikacji; 80% oceny końcowej).

Ćwiczenia składają się zajęć, które umożliwią przybliżenie różnorodności mikroorganizmów oraz podstawowych technik pracy z mikroorganizmami eukariotycznymi. Obejmują także projekt, który umożliwi studentom samodzielną pracę nad wyizolowanym przez nich organizmem. Podstawowe zagadnienia poruszane w takcie ćwiczeń obejmą:

1. Zapoznanie się z różnorodnością mikroorganizmów eukariotycznych z różnych siedlisk. Przede wszystkim glonów (np. okrzemek, bruzdnic, zielenic, euglenin), heterotroficznych protista (np. orzęski, ameby) oraz grzybów mikroskopowych i tzw. grzybopodobnych protistów. Zapoznanie się z zespołami mikroorganizmów z siedlisk słodkowodnych o różnej trofii oraz różnorodnych siedlisk glebowych. Nauka identyfikacji organizmów z wykorzystaniem kluczy.

2. Zapoznanie się z technikami pobierania prób, izolacji i hodowli mikroorganizmów eukariotycznych z różnych grup. Kolekcje kultur.

3. Poznanie technik badań morfologicznych, mikroskopia świetlna, biometria. Dokumentacja naukowa.

4. Wprowadzenie do metodyki opisu gatunków, bazy danych biologicznych, w tym danych molekularnych. Analiza literatury. Przygotowanie opisu wyizolowanego gatunku w formie krótkiej publikacji naukowej.

Celem projektu jest wyizolowanie z prób środowiskowych pobranych przez studentów „nowego” gatunku (nowego dla studentów, a z niewielkim prawdopodobieństwem nowego dla nauki), jego identyfikacja na poziomie głównych grup mikroorganizmów eukariotycznych, hodowla, dokumentacja zdjęciowa, pomiary, obserwacje, zebranie danych literaturowych, oraz danych molekularnych z baz danych i przygotowanie pracy pisemnej w formie niewielkiej publikacji naukowej, gdzie znajdzie się opis „nowego” gatunku. Projekt ten umożliwi studentom zaznajomienie się z wszystkimi etapami, które towarzyszą opisywaniu nowych gatunków.

zajęcia laboratoryjne, zajęcia terenowe, zajęcia komputerowe, dyskusja, analiza i interpretacja tekstów źródłowych, indywidualne projekty studenckie: prezentacje ustne, opracowanie pisemne