University of Warsaw - Central Authentication System

QUICK START
STUDENTS AND STAFF
FACULTIES
COURSES
- Molecular fundamentals of enzymology
STUDIES
DORMITORIES
HELP

Molecular fundamentals of enzymology

General data

Course ID:	1000-714bMPE
Erasmus code / ISCED:	13.6 Kod klasyfikacyjny przedmiotu składa się z trzech do pięciu cyfr, przy czym trzy pierwsze oznaczają klasyfikację dziedziny wg. Listy kodów dziedzin obowiązującej w programie Socrates/Erasmus, czwarta (dotąd na ogół 0) – ewentualne uszczegółowienie informacji o dyscyplinie, piąta – stopień zaawansowania przedmiotu ustalony na podstawie roku studiów, dla którego przedmiot jest przeznaczony. / (0512) Biochemistry The ISCED (International Standard Classification of Education) code has been designed by UNESCO.
Course title:	Molecular fundamentals of enzymology
Name in Polish:	Molekularne podstawy enzymologii
Organizational unit:	Faculty of Mathematics, Informatics, and Mechanics
Course groups:	Obligatory courses for 2nd year Bioinformatics
ECTS credit allocation (and other scores):	3.50 Basic information on ECTS credits allocation principles: the annual hourly workload of the student’s work required to achieve the expected learning outcomes for a given stage is 1500-1800h, corresponding to 60 ECTS; the student’s weekly hourly workload is 45 h; 1 ECTS point corresponds to 25-30 hours of student work needed to achieve the assumed learning outcomes; weekly student workload necessary to achieve the assumed learning outcomes allows to obtain 1.5 ECTS; work required to pass the course, which has been assigned 3 ECTS, constitutes 10% of the semester student load.
Language:	Polish
Type of course:	obligatory courses
Short description:	During the lecture, students will learn about the structure of enzymatic proteins, the mechanisms of enzymatic catalysis, and enzymatic kinetics. The classes will present techniques and methods useful in working with enzymes in vitro and in silico.
Full description:	Lecture: Course content: basics of chemical thermodynamics, the structure of enzymatic proteins, mechanisms of enzymatic catalysis, types of enzymatic reaction kinetics, types of catalytic reactions and enzyme classification, membrane bioenergetics systems. Classes: 1. Biochemical and enzymatic calculations. Basics of spectrophotometry. 2. Basics of simulation of chemical and enzymatic reactions using computer programs. 3. Basics of enzymatic reaction measurements. Determination of the activity of transaminases in the rabbit blood serum. 4. Measurements of enzymatic kinetics for L-lactate dehydrogenase 5. Mathematical methods for the determination of kinetic parameters of enzymes. 6. Inhibition of enzymatic reactions - simulations in computer programs and data analysis. 7. Mechanisms of enzymatic reactions - simulations in computer programs and data analysis. 8. Application of computer programs to analyze the spatial structure of enzymes.
Bibliography:	J.M Berg, J.L. Tymoczko, L. Stryer. Biochemia, Rozdziały 3,4, 8-10, PWN, Warszawa 2005 S. Strumiło, A. Tylicki. Enzymologia Podstawy, PWN, Warszawa 2020 A. Zgirski, R. Gondko Obliczenia Biochemiczne, PWN, Warszawa 1998 A. Cornish-Bowden. Fundamentals of Enzyme Kinetics, 4th Edition. Elsevier, 2014 https://iubmb.qmul.ac.uk https://www.gepasi.org https://copasi.org/
Learning outcomes:	Wiedza: Student ma opanowaną wiedzę o budowie i funkcjonowaniu enzymów (K_W04) Student ma opanowaną wiedzę na temat podstaw fizykochemicznych katalizy enzymatycznej (K_W01) Umiejętności: Student potrafi stosować podstawowe techniki i narzędzia badawcze w zakresie biologii ze szczególnym uwzględnieniem biochemii, fizyki i biologii molekularnej (K_U02) Student potrafi opisywać systemy informatyczne i bioinformatyczne w sposób zrozumiały dla laika (K_U14) Kompetencje: Student jest przygotowany do precyzyjnego formułowania pytań, służących pogłębieniu własnego zrozumienia danego tematu lub odnalezieniu brakujących elementów rozumowania (K_K02) Student jest przygotowany do samodzielnego wyszukiwania informacji w literaturze i zasobach internetowych, także w językach obcych (K_K03)
Assessment methods and assessment criteria:	Written reports and an exam covering the knowledge of the lectures

Classes in period "Summer semester 2023/24" (in progress)

Time span:	2024-02-19 - 2024-06-16	Selected timetable range: weekly course term Navigate to timetable MO TU WYK CW W TH FR
Type of class:	Classes, 30 hours more information Lecture, 15 hours more information
Coordinators:	Radosław Mazur
Group instructors:	Maciej Garstka, Radosław Mazur
Students list:	(inaccessible to you)
Examination:	Examination

Course descriptions are protected by copyright.
Copyright by University of Warsaw.