University of Warsaw - Central Authentication System

Biochemical Analysis

General data

Course ID:	1400-225ABCH
Erasmus code / ISCED:	13.604 Kod klasyfikacyjny przedmiotu składa się z trzech do pięciu cyfr, przy czym trzy pierwsze oznaczają klasyfikację dziedziny wg. Listy kodów dziedzin obowiązującej w programie Socrates/Erasmus, czwarta (dotąd na ogół 0) – ewentualne uszczegółowienie informacji o dyscyplinie, piąta – stopień zaawansowania przedmiotu ustalony na podstawie roku studiów, dla którego przedmiot jest przeznaczony. / (unknown)
Course title:	Biochemical Analysis
Name in Polish:	Analiza biochemiczna
Organizational unit:	Faculty of Biology
Course groups:	(in Polish) Przedmioty obieralne na studiach drugiego stopnia na kierunku bioinformatyka Elective subjects Facultative courses, BIOLOGY, specialization level (2nd study cycle), spec.: BM Facultative courses, BIOLOGY, specialization level (2nd study cycle), spec.: MO
ECTS credit allocation (and other scores):	6.00 Basic information on ECTS credits allocation principles: the annual hourly workload of the student’s work required to achieve the expected learning outcomes for a given stage is 1500-1800h, corresponding to 60 ECTS; the student’s weekly hourly workload is 45 h; 1 ECTS point corresponds to 25-30 hours of student work needed to achieve the assumed learning outcomes; weekly student workload necessary to achieve the assumed learning outcomes allows to obtain 1.5 ECTS; work required to pass the course, which has been assigned 3 ECTS, constitutes 10% of the semester student load.
Language:	Polish
Type of course:	elective courses obligatory courses
Requirements:	Biochemistry 1400-113BCH Organic Chemistry 1200-112CHOR
Prerequisites:	Biochemistry 1400-113BCH Organic Chemistry 1200-112CHOR
Prerequisites (description):	(in Polish) Znajomość podstawowych zagadnień z chemii organicznej oraz biochemii.
Short description:	Topics of presentations: Separation of various organelles. Extraction and separation of DNA, RNA, proteins and lipids; different types of chromatography (CC, TLC, GC, HPLC), solid phase extraction, molecular filtration, electrophoresis, VIS/UV and IR spectrophotometry, NMR and mass spectrometry, potentiometry, radiometry, spinning. Practices: Preparing and characterization of buffers, separation and determination of molecular weight of proteins by electrophoresis and molecular filtration, applying of spectophotometry and chromatography in determination of the structure and properties of selected compounds, obtaining of plant protoplasts from leaf tissue, bioassays of enzyme activity, applying of radioactive precursors in investigation of methabolic pathways.
Full description:	Topics of presentations: Isolation of protoplasts, nucleus, chloroplasts, mitochondria, Golgi membranes, microsomes, DNA, RNA, proteins, amino acids, carbohydrates, lipids. Methods of separation and purification of biomolecules: adsorption chromatography, column chromatography (CC), thin-layer chromatography (TLC), gas chromatography(GL), high performance liquid chromatography (HPLC), ion exchange chromatography, affinity chromatography, hydrophobic interaction chromatography, immobilized metal ion affinity chromatography, solid phase extraction, molecular filtration, electrophoresis, dialysis, electrodialysis. VIS/UV and IR spectrophotometry, NMR and mass spectrometry, radiometry, spinning. Practices: 1. Determination of molecular weight of proteins by molecular filtration. 2. Electrophoretic analysis of proteins in polyacrylamide gel. 3. Potentiometric titration of amino acids. 4.Determination of buffer capacity.5. Determination of pK of uracil by spectrophotometric methods.6 Isolation of protoplasts from leaf mesophyll of marigold. 7. Incorporation of CH314COONa into oleanolic acid in protoplasts isolated from marigold leaves.8. Application of CH314COONa in labelling of sterols in marigold shoots. 9. Examination of phenylalanine ammonia lyase activity from barley hypocotyls. 10. Influence of functional groups on chromatographic properties of selected compounds. 11. Determination of the structure of flavonoids by spectral analysis.
Bibliography:	1. Devlin T.M., Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations, John Wiley&Sons Inc. Hoboken 2006 2. Matthews H.R., Freedland R.A., Miesfeld R.L., Biochemistry a Short Cours, John Wiley&Sons Inc. 1997
Learning outcomes:	(in Polish) Biologia – Biologia molekularna Zna różnorodne techniki i narzędzia badawcze (metody izolowania i charakteryzowania komórek, organelli komórkowych, makrocząsteczek i związków drobnocząsteczkowych), stosowane w naukach biologicznych. (S2_W01) Zna zasady planowania eksperymentu oraz podstawy stosowania różnych metod analitycznych w biochemii. (S2_W03) Zna i rozumie zasady funkcjonowania prostej aparatury analitycznej. (S2_W03) Potrafi pod nadzorem opiekuna naukowego zaplanować i wykonać eksperyment z zastosowaniem poznanych metod analitycznych; umie zaproponować techniki przeprowadzenia wskazanych oznaczeń oraz ocenić ich przydatność dla badanego materiału (S2_U01) Potrafi zbierać i interpretować dane empiryczne. (S2_U01) Potrafi dyskutować o zastosowaniach metod analitycznych i poprawnie wnioskować na podstawie danych z różnych źródeł, w tym literatury naukowej i źródeł elektronicznych (S2_U02) Potrafi pracować w zespole, realizując własne badania i współorganizując pracę całego zespołu (S2_U03) Wykazuje odpowiedzialność za zagrożenia wynikające ze stosowanych technik badawczych i dba o bezpieczne warunki pracy. (S2_K03) Biologia – Mikrobiologia ogólna Zna różnorodne techniki i narzędzia badawcze (metody izolowania i charakteryzowania komórek, organelli komórkowych, makrocząsteczek i związków drobnocząsteczkowych), stosowane w biochemii. (S1_W02) Zna zasady planowania eksperymentu oraz podstawy stosowania różnych metod analitycznych. (S1_W03) Zna i rozumie zasady funkcjonowania prostej aparatury analitycznej stosowanej w analizie biochemicznej. (S1_W04) Potrafi pod nadzorem opiekuna naukowego zaplanować i wykonać eksperyment z zastosowaniem poznanych metod analitycznych; umie zaproponować techniki przeprowadzenia wskazanych oznaczeń oraz ocenić ich przydatność dla badanego materiału (S1_U01) Potrafi zbierać i interpretować dane empiryczne. (S1_U01) Potrafi dyskutować o zastosowaniach metod analitycznych i poprawnie wnioskować na podstawie danych z różnych źródeł, w tym literatury naukowej i źródeł elektronicznych (S1_U02) Potrafi pracować w zespole, realizując własne badania i współorganizując pracę całego zespołu (S1_U03) Wykazuje odpowiedzialność za zagrożenia wynikające ze stosowanych technik badawczych i dba o bezpieczne warunki pracy. (S1_K04)
Assessment methods and assessment criteria:	(in Polish) Ocenie podlegają wykonanie i opisy ćwiczeń laboratoryjnych, przygotowanie i wygłoszenie referatu oraz egzamin końcowy. Warunki zaliczenia zajęć: uczestnictwo w co najmniej 85% zajęć, aktywny udział w pracach laboratoryjnych, przygotowanie sprawozdań z wykonywanych ćwiczeń (obejmujące opracowanie wyników eksperymentów), przygotowanie i wygłoszenie prezentacji ustnej (seminarium) na temat wyznaczony przez prowadzącego. Warunki zaliczenia egzaminu: Egzamin pisemny (opisowy, pytania otwarte). Do egzaminu mogą przystąpić jedynie studenci, którzy zaliczyli ćwiczenia. Warunkiem zaliczenia egzaminu jest uzyskanie co najmniej 50% punktów.
Practical placement:	(in Polish) Brak

Classes in period "Winter semester 2023/24" (past)

Time span:	2023-10-01 - 2024-01-28	Selected timetable range: weekly course term Navigate to timetable MO TU W TH LAB FR SEM LAB
Type of class:	Lab, 75 hours, 30 places more information Seminar, 15 hours, 30 places more information
Coordinators:	Anna Szakiel
Group instructors:	Anna Szakiel
Students list:	(inaccessible to you)
Examination:	Course - Examination Lab - Grading Seminar - Examination

Classes in period "Winter semester 2024/25" (future)

Time span:	2024-10-01 - 2025-01-26	Selected timetable range: weekly course term Navigate to timetable MO TU W TH LAB FR SEM LAB
Type of class:	Lab, 75 hours, 30 places more information Seminar, 15 hours, 30 places more information
Coordinators:	Anna Szakiel
Group instructors:	Anna Szakiel
Students list:	(inaccessible to you)
Examination:	Course - Examination Lab - Grading Seminar - Examination

Course descriptions are protected by copyright.
Copyright by University of Warsaw.